Начиная с 6-7 лет дети начинают проходить курс обучения в начальной школе (Sekolah Dasar, SD), который длится 6 лет. Затем в течение 3-х лет обучаются в средней школе первой ступени или неполной средней школе (Sekolah Menengah Pertama, SMP).

По завершении трехгодичного курса средней школы первой ступени в рамках обязательной программы обучения (она длится 9 лет), учащиеся сдают государственный экзамен, и в случае успешной сдачи получают сертификат о начальном (базовом) среднем образовании.

По результатам академического и психологического тестирования выпускники неполной средней школы могут получить возможность продолжения учебы и получения законченного среднего образования в средней школе верхней ступени или по другому названию – старшей школе (Sekolah Menengah Atas, SMA) или в средней профессиональной школе (Sekolah Menengah Kejuruan, SMK), где они могут приобрести специальные навыки и получить базовое техническое образование.

Так же как и в неполной средней школе курс обучения в старшей школе рассчитан на три года.

В Индонезии, помимо светского, можно получить исламское образование. Однако страна принимает гостей любых религий и мировоззрения, поэтому за другую веру и за нерелигиозность дискриминации не существует.

Неуклонно растет процент населения, достигшего школьного возраста и посещающего учебные заведения. В 2009 году в начальной школе проходило обучение около 98% всех индонезийцев в возрасте от 7 до 12 лет.

Процент посещаемости в неполной средней школе для возрастной группы от 13 до 15 лет составил 85%. Однако продолжить обучение в старшей школе смогли лишь 55% потенциальных учащихся в возрасте от 16 до 18 лет. Тем не менее, следует отметить, что за последние 15 лет этот показатель вырос почти на 10%.

Раньше учебные заведения Индонезии не считались престижными и предлагали не самое качественное образование, однако сейчас ситуация изменилась – экономика страны неуклонно растет, рынок труда нуждается в высококвалифицированных специалистах, иностранные инвестиции постоянно толкают развитие страны вперед. Следовательно, индонезийские колледжи больше не являются заведениями второго сорта.

Система высшего образования (Perguruan Tinggi) представлена более чем 1600 высшими учебными заведениями (государственными и частными) – академиями / akademi (ВУЗами, обеспечивающими обучение прикладным наукам в одной узкоспециализированной отрасли профессиональных знаний), институтами / institut (с несколькими факультетами, обеспечивающими академическое и профессиональное образование по смежным областям профессиональных знаний), политехническими институтами / politeknik или institut teknologi (предоставляющими профессиональное образование по нескольким специальным отраслям знаний), высшими школами / sekolah tinggi (так в Индонезии называются высшие учебные заведения, предоставляющее академическое и профессиональное образование в рамках одной дисциплины в области науки, технологии или искусства) и университетами / universitas (высшими учебными заведениями с несколькими факультетами, обеспечивающими образование в нескольких различных дисциплинах, отраслях знаний и искусства).

К числу крупнейших и наиболее престижных университетов страны относится Университет Индонезии в Джакарте, основанный официально как Universiteit Indonesia (в дальнейшем переименованный в Universitas Indonesia) в феврале 1950 года.

История университета началась в середине 19-го века, в эпоху колониального господства, когда голландская администрация создала в 1851 году школу для подготовки врачей с сертификатом о базовом медицинском образовании, которая с течением времени и после многочисленных трансформаций была постепенно преобразована сначала в Институт высшего образования Республики Индонезии с тремя факультетами, затем во временный университет, и, наконец, в полноценный государственный университет.

Еще один старейший ВУЗ страны – Университет Гаджах Мада (Universitas Gadjah Mada) в Джокьякарте был основан в первые годы независимости – в декабре 1949 года.

Студенты-выпускники университетов в зависимости от сроков обучения и уровня подготовки получают академические степени бакалавров (Sarjana), магистров (Magister), докторов (Doktor) или специалистов (Spesialis).

Система светского начального, среднего и высшего образования в Индонезии входит в сферу ответственности Министерства образования и культуры (Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan), религиозного (в исламских школах) – организуется Министерством по делам религий (Kementerian Agama). В Индонезии также действует множество частных школ и университетов, которые также предоставляют качественное образование.